تم تأسيس قسم التشريح بكلية الطب جامعة الحدود الشمالية   فى كلية الطب منذ بدايتها  في العام - 1430ھ الموافق 2009 م و مقره بالمبنى الرئيسى للكلية شطر البنين بالدور الارضى  حيث يخدم طلبة كلية الطب و كلية العلوم التطبيقية و حديثا كلية التمريض أما بالنسبة لشطر البنات  انشاء القسم فى مبني كلية طب و كلية العلوم التطبيقية و التمريض بنات في نفس العام الذى انشأ فيه في شطر البنين  يوجد بالقسم فى شطري الطلاب و الطالبات : عدد كاف من المعامل  (قاعات للتشريح -غرفة ثلاجة لحفظ جثامين التشريح – معامل للأنسجة - متحف لنماذج  التشريحية المصنعة) كما يتوافر بشطرى البنين و البنات معمل التشريح الثلاثى